Microbiologia
PESQUISADOR PRINCIPAL
- Najla Benevides Matos - Bióloga, Doutora em Microbiologia/Instituto Pasteur/Paris /França
EQUIPE
- Maria Sandra da Costa Amaral - Bióloga, Mestre/PGBIOEXP/UNIR, técnic/IPEPATRO.
- Taise Ferreira Vargas - Bióloga, Mestre/PGBIOEXP/UNIR, técnic/IPEPATRO.
- Grecy Kelli Estevam Sales - estudante de Biologia, estagiária IC/PIBIC/CNPq/ IPEPATRO.
COLABORAÇÕES
COLABORADORES INTERNACIONAIS
- Cécile Wandersman, Doutora, Chefe de unidade de Membranas bacterianas do Instituto Pasteur/Paris/França.
COLABORADORES NACIONAIS
- Yvone Gabbay Mendes, Doutora, Virologista do Instituto Evandro Chagas/ Belém/PA
PROJETOS DE PESQUISA EM ANDAMENTO
- Caracterização etiológica e molecular das bactérias e vírus associados à gastroenterite em crianças de 0 a 6 anos de idade na região de Porto Velho-RO. Palavras-chave: enterobactérias, vírus entéricos, diarréia infantil
Em Rondônia, são poucos os dados referentes à identificação dos agentes etiológicos envolvidos nas infecções diarréicas infantis locais. Desta forma a proposta desta pesquisa é determinar a prevalência dos enterovírus, caracterizando os genótipos circulantes e ainda identificar a etiologia das enterobactérias. O estudo iniciou-se no laboratório de Microbiologia do Cepem no mês de março de 2010. Durante o período de março a maio de 2010, foram coletadas 119 amostras de fezes diarréicas de crianças de zero a seis anos de idade de ambos os sexos hospitalizados no setor de gastroenterites do Hospital infantil Cosme e Damião. Os principais sintomas que acometiam essas crianças foram diarréia aguda, seguida de febre e vômito. Para uma triagem inicial, todas as 119 amostras fecais coletadas foram analisadas para positividade de rotavírus pelo teste de aglutinação em látex, destas amostras analisadas 51 (42,9%) apresentaram resultado positivo para rotavírus do grupo A. Para confirmação da presença do rotavírus, as 51 amostras previamente triadas pelo método de aglutinação em látex foram submetidas à extração do RNA viral para posterior análise do perfil eletroforético genômico característico do rotavírus. Através da análise do perfil eletroforético das amostras, pudemos confirmar que houve a associação do rotavírus em 21 (45,6%) dos casos de diarréia aguda diagnosticada em crianças hospitalizadas no setor de gastroenterites do Hospital Cosme e Damião. Através da análise do perfil eletroforético, pudemos contatar preliminarmente que houve apenas infecções por rotavírus do grupo A e observamos também a predominância do perfil eletroforético longo em nossas amostras. As rotaviroses incidiram na faixa etária de zero a quatro anos, sendo observado que há um aumento crescente do número de casos até um ano de idade, quando então este número decresce, podendo indicar uma maior vulnerabilidade à infecção por rotavírus, nas faixas etárias abaixo de um ano. Estes são dados preliminares não nos permite ainda inferir em conclusões consolidadas, contudo, já demonstrou a relevância avaliar a epidemiologia local dos rotavírus A, que contribuirá para o atual processo de estratégia de imunização em vigor, bem como a participação dos adenovírus, norovírus, astrovirus e enterobactérias implicados no quadro de gastroenterite. Fonte financiadora: IPEPATRO.Vigência do projeto: 2010-12
- Caracterização do sistema de aquisição de heme “HemX” de Serratia marcescens. Palavras-chave: Serratia marcescens, Heme uptake
Recentes estudos sobre a coordenação dos sistemas Has e Hem de S. marcescens mostraram que a inativação dos dois sistemas na cepa SM365 de S. marcescens inativa a entrada de heme. A utilização de diferentes concentrações de hemoglobina compreendida entre 10-5 a 10-8 M e em condições de baixa e alta carência em ferro, não permitiram a ativação do sistema HemX de Serratia marcescens (Benevides-Matos,N. et al. 2010). Supomos que a ausência de atividade do terceiro sistema de aquisição de heme na cepa SM365 de S. marcescens seja devido a uma fonte de heme não explorada em nossos estudos. Para procurar as fontes de heme utilizadas por este sistema, o gene hemX que codifica o receptor de membrana externa está sendo clonado no plasmídio de baixo números de copias pAM 239 para posteriormente ser introduzido em uma cepa de E. coli (C600 ∆ hemA), neste caso heme é transportado pelo receptor de membrana externa permitindo o crescimento da cepa. Nós testaremos a capacidade desta cepa de adquirir outras fontes de heme como, por exemplo: haptoglobine, hemopexine, albumina, mioglobina e leghemoglobine e posteriormente analisar a dependência do sistema HemX em relação ao complexo TonB/ExbB/ExbD. Fonte financiadora: CNPq. Vigência do projeto: 2010-13
PUBLICAÇÕES
PUBLICAÇÕES EM REVISTAS INDEXADAS
- BENEVIDES MATOS, NAJLA AND BIVILLE F. The Hem and Has haem uptake systems in Serratia marcescens. Microbiology (2010), 156, 1749-1757.
APRESENTAÇÃO DE RESUMOS EM CONGRESSOS NACIONAIS
- BENEVIDES MATOS-N, BIVILLE F. AND WANDERSMAN C. Função das proteínas TonB e HasB no transporte de heme pelos receptores de membrana externa de Serratia marcescens. 25°Congresso Brasileiro de Microbiologia 08 a 12 de novembro/2009
ORIENTAÇÕES EM ANDAMENTO
ORIENTAÇÕES DE IC
- Grecy Kelli Estevam Sales – estudante de Biologia, bolsista PIBIC/CNPq/IPEPATRO
BALANÇO DO ANO DE 2009
Após um período de latência compreendido de aproximadamente três anos, o laboratório de microbiologia do Cepem/Ipepatro reiniciou suas atividades em junho de 2009.
Houve a necessidade de rever as prioridades dos estudos que seriam realizadas no laboratório, a reorganização dos trabalhos, assim como compra de materiais de consumo para o início efetivo das atividades. A dinâmica burocrática para a compra dos materiais de consumo para reestruturação do laboratório de microbiologia retardou o início dos trabalhos práticos por mais de seis meses. Durante esse período revemos as condições de trabalho do laboratório, escrevemos projetos de parcerias como por ex.: 1 - Intervenção do laboratório de Microbiologia durante o período de implantação da usina hidrelétrica do Jirau no Município de Porto Velho-RO; 2 - Vigilância epidemiológica de infecções hospitalares e controle de microrganismos multirresistentes no serviço de UTI do hospital CEMETRON; 3 - Estudo do perfil etiológico das meningites bacterianas e virais isoladas de crianças e adultos na região de Porto Velho-RO; 4 - Caracterização genotípica das Escherichia coli diarreiogênicas isoladas de crianças de 0 - 6 anos no município de Porto Velho-RO e 5 - Caracterização etiológica e molecular dos enterovírus associados à gastroenterite em crianças de 0 a 6 anos de idade na região de Porto Velho-RO.
Atualmente estamos desenvolvendo o quarto projeto acima citado e realizando um trabalho contínuo e com responsabilidade consciente, com a realização das coletas no Hospital Cosme e Damião de forma sistemática e sem empecilhos por parte da direção do CEPEM e com a cooperação consciente por parte da administração e colegas de outros laboratórios.
O laboratório de Microbiologia do Cepem/Ipepatro vem se alicerçando com base nas atividades centrais como as diarréias infantis, infecções respiratórias e meningites bacterianas, pois consideramos indispensáveis a serem acompanhadas e estudadas no estado de Rondônia. O laboratório iniciou há seis meses a pesquisa sobre a Caracterização dos enteropatógenos responsáveis pelas diarréias infantis na região de Porto Velho-RO. Temos realizado coletas em crianças de 0 a 6 anos com síndromes diarréicas internadas no Hospital Infantil Cosme e Damião. Estas coletas nos permitem realizar uma prestação de serviço à população que participa do nosso estudo, assim como identificar os agentes etiológicos responsáveis pelas diarréias infantis, acompanhar o perfil de resistência bacteriana das cepas isoladas devido ao uso indiscriminado dos antibióticos, e ainda avaliar o impacto da vacina contra rotavírus implantada no Brasil, implicando na necessidade de um estudo pontual a ser realizado no estado de Rondônia.
Para a realização do estudo do perfil etiológico das meningites bacterianas e virais isoladas de crianças e adultos na região de Porto Velho-RO, o Instituto de Pesquisa em Patologias Tropicais, proporcionou a Msc. Taise Ferreira Vargas a realização da formação “Diagnósticos das Meningites bacterianas”, capacitação esta realizada no Instituto Adolfo Lutz. Estamos nos preparado para a introdução desta pesquisa em nossa unidade e aguardamos melhores condições de infra-estrutura para o início das atividades.
Introduzimos também no laboratório de microbiologia uma nova perspectiva de pesquisa sobre o estudo dos sistemas de aquisição de heme em bactérias. Esta pesquisa tem avançado gradativamente apesar de algumas dificuldades encontradas no decorrer da implantação deste sujeito.
Apesar das dificuldades e do pouco tempo de estudos, temos observado que nossas pesquisas vêm apresentando resultados interessantes e pertinentes, o que nos estimula a continuar acreditando nos trabalhos desenvolvidos em Rondônia com a cooperação de outros grupos de pesquisa.
PLANO DE TRABALHO PARA 2010
Para o ano de 2010, iremos investir em qualificação de pessoal de apoio técnico, graduação e pós-graduação. Objetivaremos no recrutamento de alunos de iniciação científica e mestrado para a formação de uma massa crítica na área da microbiologia propiciando o desenvolvimento dos projetos almejados.
Procuraremos expandir nossas colaborações com pesquisadores renomados nas áreas de pesquisas implantadas no laboratório de microbiologia. Alguns contatos já foram feitos e a realizações de projetos em parcerias com grupos da USP de São Paulo e Evandro Chagas em Belém, estão em andamento para serem efetivamente implantados em 2011.
Concretizaremos os resultados de nossas pesquisas em forma de artigos científicos, no domínio dos vírus e bactérias enteropatogênicas o que consolidara a seriedade dos trabalhos realizados nesta unidade. Como conseqüência a participação em congressos, simpósios ou encontros serão indispensáveis para uma divulgação prévia dos resultados encontrados, esclarecimento de outras pesquisas realizadas no Brasil ou no exterior e ainda possibilitando o encontro com outros pesquisadores podendo formar novas colaborações.
A submissão de pelo menos dois projetos aos órgãos de amparo e financiamento das pesquisas é uma meta primordial para o laboratório de microbiologia. Sabemos das dificuldades encontradas para obtenção de fomento, por isso iremos apresentar projetos com metas consolidadas e pertinentes que permitam concorrer com unidades de outros centros.
O laboratório de Microbiologia tem atualmente a necessidade de pessoal de apoio técnico, pois nossas atividades são árduas e requer apoio de base sólida, para que possamos ter tempo para pensar de forma crítica no que é relevantemente científico e importante para a sociedade.